他の船と同盟を組むことで協力プレイがより便利になるシステム。

協力して他のプレイヤー船を倒したり、ガイコツ船やフレイムハート船団を攻略する専用の褒賞もある

報酬山分けなども深く考えなくて済むので便利

勘違いする人が多いので説明するが、同盟に売った額の半額のゴールドと名声が、同盟相手に付与されるが自分の売却額は減ることはないので、単純に組んでおくだけで美味しいデメリットのないシステムである

つまり自分の船が通常 1,000 ゴールドの宝箱を売った場合、自船の船員は 1,000 ゴールド、同盟の船員には 500 ゴールドが加算される

• 同じワールド内の船同士である
• ある程度、船同士を接近させる
• メインマストの船の旗の箱を操作する
  • お互いの船の船員が合意して船の旗の箱を操作する必要がある
  • 相手の船の船の旗の箱を勝手に操作することはできない
• すでに同盟旗以外の他の旗を上げている場合は一旦解除する

1. 誘う側が 「同盟に誘う」 の旗を選択する
2. 誘われる側が 「同盟に入る」を選択する（周囲に「同盟に誘う」の旗を上げている船がいないと選択肢がでない）
3. 同盟旗が上がり、同盟が結成された旨のメッセージが表示される

• 同盟のプレイヤー名は紫色で表示される(2.0.15 Lost Treasures アップデートにて変更された)
  • また、ダウンした同盟プレイヤーも蘇生させることができる
• ワールドにいる全ての船と同盟を組むことも可能
  • 船の数が増えることによって、獲得できるゴールドに変化はない（売却した船がゴールドや名声を全額、そのほかの同盟船が半額入手する）
• 船の地図に常に同盟船が表示されるようになる
  • 帆(マスト)の数で船の種類が判別可能
• NPC に宝箱などを売却した際、通常の売却処理に加えて、自分の船の売価の半分が相手の船の船員にも加算され、評価も上昇する
  • 自分達の売価が下がるわけではないので、単純に双方に得がある
  • 自分の船が 1,000 ゴールドの宝箱を売った場合、自船の船員は 1,000 ゴールド、同盟の船員には 500 ゴールドが加算される
  • ただし、実績・褒賞などの条件で売却個数が問われる場合、自分の船の船員以外が売却したものは加算対象にならないので注意する
• よくある勘違いの注意点
  • 同盟同士であっても他の船のプレイヤーを倒すこともできる
  • 同盟同士であっても通常の他のプレイヤーと同様に接触判定があるため、通行を妨害することができる
  • 同盟同士であっても他の船に大砲の弾は当たるので沈めることができる

• 同盟の船か自分の船の船員全員がゲームを抜けたとき
• 旗の箱から同盟を抜けるを選択したとき

それぞれ同盟が解除された旨のメッセージが表示される

• 同盟旗の色についてはランダム？
  • 海域によって変わる説、ワールド内の同盟の数によって変わっているなどの説がある
• 装備品の拡声器のテンプレートテキストチャットの中に、「同盟を組もう」という内容のものがある