他の船と同盟を組むことで協力プレイができるようになるシステム。

協力して他の船を倒す、スケルトン船やスケルトン砦を攻略するときの報酬山分けの際などに便利

単純に組んでおくだけでも美味しい

• 同じワールド内の船同士である
• ある程度、船同士を接近させる
• メインマストの旗 (Flag box)を操作する
  • お互いの船の船員が合意して旗を操作する
  • 相手の船の旗を勝手に操作することはできない
• すでに同盟旗以外の他の旗を上げている場合は一旦解除する

1. 誘う側が Offer Alliance の旗を選択する
2. 誘われる側が Join Alliance を選択する（周囲に Offer Alliance の旗を上げている船がいないと選択できない）
3. （Offer/Join Alliance の旗の下あたりと、全てのマストに）同盟旗が上がり、同盟が結成された旨のメッセージが表示される

• 同盟のプレイヤー名は紫色で表示される(2.0.15 Lost Treasures アップデートにて変更された)
  • また、ダウンした同盟プレイヤーも蘇生させることができる
• 最大6隻くらいの同盟が組める模様（上限は未確認）
  • 船の数が増えることによって、獲得できるゴールドに変化はない
• 船の地図に常に同盟船が表示されるようになる
  • 帆(マスト)の数で船の種類が判別可能
• NPC に宝箱などを売却した際、通常の売却処理に加えて、自分の船の売価の半分が相手の船の船員にも加算され、評判も上昇する
  • 自分達の売価が下がるわけではないので、単純に双方に得がある
  • 自分の船が 1,000 ゴールドのチェストを売った場合、自船の船員は 1,000 ゴールド、同盟の船員には 500 ゴールドが加算される
  • ただし、実績などの条件で売却個数が問われる場合、自分の船の船員以外が売却したものは加算対象にならないので注意する
• よくある勘違いの注意点
  • 同盟同士であっても他の船に大砲の弾は当たるので沈めることができる
  • 同盟同士であっても他の船のプレイヤーを倒すこともできる

• 同盟の船か自分の船の船員全員がゲームを抜けたとき
• Flag box から Leave Alliance を選択したとき

それぞれ同盟が解除された旨のメッセージが表示される

• 同盟旗の色についてはランダム？
  • 海域によって変わる説、ワールド内の同盟の数によって変わっているなどの説がある
• 装備品の拡声器のテンプレートテキストチャットの中に、「同盟を組もう」（Let's form an alliance!）という内容のものがある