メインマストの上にある箱で旗が変更可能。

多くは見た目を変更する目的のもので、友好的であることを示すために使われたりしている模様。

下記の通りいくつかは特殊な効果がある

• 別のタブ(Alliances)にあり、同盟を組むのに必要
• 詳細は 同盟 システム参照

• 真っ赤な海賊旗
  • 遠くから見てもかなり目立つ発光する赤
• 旗を上げている間、同じワールドの全ての他のプレイヤーの船に、自分の船の位置が地図上に通知される
  • 本来は「ここに俺たちがいるから、PvP がしたい船はかかってこい！」という意味の旗なので、この旗を揚げる際は注意
  • 但し、同盟と違い、船の種類はわからない
• いくつかの褒賞の解除にはこの旗を上げたままで進行する必要がある

なお、この方法は、全員が同じ地域（例えば日本）に住んでいる前提でのみ成功します。

他の地域に住んでいる場合は、最も近い地域のサーバーにマッチングされるため失敗します。

1. ほぼ同じタイミングで 非公開クルーで船を建てる（時間が大きくズレると成功率が下がる？）
2. このとき、できれば全員バラバラで建てる（8人で最終的に2ガレオンで遊びたいなら、8ガレオンを建てる）
3. 同じワールド内にいることを確認できる手段で確認する（以下のような方法があります）
   1. マストに登り、死神の印の旗 を建てて、地図を確認し、お互いの船が地図上に映っているか確認する
   2. 特使に投票し、リーパーズ・ボーンの特使になり、地図を確認し、お互いの船が地図上に映っているか確認する
   3. 何らかの方法で死亡して、「呪われし者の渡し船」で会えるか確認する
4. お互いが確認できれば成功

成功したら、一通り協力しないと達成できない 実績 などをやるといい

• 5人で楽器を演奏
• 自分の船から他の船のメンバーをカトラスのチャージ攻撃で海に突き落とす
• 呪われし者の渡し船(死亡後の幽霊船)で他の海賊とチャットをする
• 自分の船の大砲で自分を撃ち出して、相手の船の上に着陸する
• カトラスで攻撃を防御されてから、5秒以内に攻撃を受ける
• 他の船と大砲を撃ち合わずに数分間航行する
• 他の船から譲ってもらうか盗んだ宝箱を売る
• カトラスの相手にバケツに貯めた吐瀉物（ゲロ）をかける？
• 盗んだ船長の宝箱を売る
• カトラスで攻撃をブロックしてから5秒以内に相手を切る
• 他の船の食料を奪って売る

など

褒賞 を参照

• ビルジラットのイベント、大砲でしか行けない場所の椅子に他の船員と座わる
• ガイコツ砦で火薬樽の連鎖爆発させる
• 全ての照明を同盟船全てで同じ色にする

など